易胖体质是因为“胖菌”?Nature Medicine最新研究揭示肠道微生物SNP与宿主BMI的关系

都说瘦子吃什么都不会胖,而胖子喝口水的能长两斤。关于长胖的原因,除了一直以来的“个人肥胖基因论”,近年来“瘦子菌”论也逐渐成熟,成为研究热点。即瘦子之所以瘦是因为他们体内的肠道微生物的种类与胖子的肠道菌群有所不同。以往的很多研究都聚焦在肥胖人群中肠道菌群的种类和丰度,很少有研究关注肠道微生物的基因与宿主肥胖的关系。

最近,Liron Zahavi等人在Nature Medicine发表了一篇题为Bacterial SNPs in the human gut microbiome associate with host BMI的文章则揭示了这一关联,表明了肠道微生物组中细菌的单核苷酸多态性(SNP)与宿主的体重指数(BMI)之间的相关性

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单核苷酸多态性(SNP)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。全基因组关联研究(GWAS)是指通过扫描参与者基因组中数百万个单核苷酸多态性(SNPs),以寻找与疾病风险或其他性状相关的变异。这里则是将GWAS应用于人体微生物的基因变异与人体疾病的关联。

这项研究从7190个健康个体的队列中收集并获得了肠道宏基因组样本,使用全基因组关联研究(GWAS),进行SNP检测,随后将细菌SNP与宿主表型进行系统性地关联分析。

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10.1038/s41591-023-02599-8

在用MWAS框架测试的12,686,191个细菌SNP与宿主BMI的相关性中,对于每个SNP,创建了一个线性回归模型,以主要等位基因频率作为自变量,BMI作为因变量。使用模型中估计的SNP的P值计算了每个SNP-BMI对之间关联的统计显著性。结果发现了1358个与宿主BMI相关的细菌SNP。通过聚类过程,最终得到了40个与BMI 显著相关的独立SNP。

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